Schnittstellen: Lexware Office besitzt eine eigene API. Bei den Lexware Desktop-Produkten steht eine API nur in den pro- und premium-Versionen zur Verfügung. Die APIs von Office und Desktop sind unterschiedliche Schnittstellen und nicht automatisch austauschbar.

Anlagenverwaltung: Sie ist in Lexware Buchhaltung premium und Lexware Financial Office premium enthalten. Bei anderen Desktop-Versionen wird Lexware Anlagenverwaltung als gesondertes Programm benötigt.

Lexware Office ist cloudbasiert: Die Anwendung wird im Browser genutzt und die Daten werden in der Cloud gespeichert.

Lexware Desktop wird auf Windows-Systemen installiert; die Daten liegen lokal beziehungsweise in der eigenen Serverumgebung. Einen vorgesehenen Mehrplatz- und Netzwerkbetrieb bieten grundsätzlich die pro- und premium-Versionen. Ein Zugriff von außerhalb des eigenen Standorts setzt bei Desktop eine entsprechend eingerichtete eigene IT-Infrastruktur voraus.